Для этого добавим в конфиг /etc/mysql/my.cnf следующие строки: после skip-innodb или #skip-innodb:
default-character-set=utf8 character-set-server=utf8 collation-server=utf8_general_ci init-connect="SET NAMES utf8" skip-character-set-client-handshake
После
[mysqldump] ... max_allowed_packet = 16M
добавим default-character-set=utf8
Перезапустим mysql:/etc/init.d/mysql restart